夏日炎炎，微生物大量繁殖，宠物食品更容易出现微生物安全问题。尤其是营养成分齐全的主粮，微生物污染的风险很高。相对而言，灌装食品的风险会低一些，超高温的加工方式规避了很多污染可能。而宠物零食类食品的微生物污染风险一般介于两者之间。不管是生产厂家还是宠物主，在夏季都需要重点关注宠物食品中的微生物安全问题。根据梅里埃营养科学食品安全蓝皮书的最新数据，2022年世界范围内宠物食品主要面临的问题有：沙门氏菌、肠杆菌科、异物、添加剂、授权问题、硒、铅、钴等。
此外，从输美、输欧的预警通报中也能得知，我国宠物食品最常见的通报原因是致病菌及微生物污染，主要是沙门氏菌和肠杆菌科。
由于鸡、鸭等禽畜类动物体内天然含有沙门氏菌，而鸡肉、鸭肉等动物性食品作为常见的宠物食品原料，感染沙门氏菌的可能性很高，一旦发生污染事件，对公共卫生安全的影响很大，会对宠物和人类健康造成伤害。对宠物而言，可能会因感染沙门氏菌生病，比如腹泻、呕吐、食欲不振、发烧、便血等等。如果宠物不发病但携带了沙门氏菌，可能会传染给其他宠物或人类，影响身体健康。宠物食品一旦污染致病的肠杆菌科，不仅会对宠物身体健康造成影响，还有概率通过接触转移到家庭环境中，进而对老幼病残人群的身体健康造成影响。因此，在接触宠物食品前后，要特别注意手部清洁，以免发生感染。在原料、配方、生产、质量检验、储存、运输等各个环节做好管控，做好环境监控，保障成品质量。首先要重视原料质量，加强监管和检验检测，搭建完善的原料、流通等生产全过程安全监管，确保原材料（尤其是动物性食品）符合食品安全标准，将监管重点从成品转移到各个环节；其次要重视食品生产过程中的卫生控制，包括设备和人员卫生控制，提高员工的卫生意识和安全意识；然后需要提高检验检测能力，不管是工厂自检还是第三方机构送检，都要能够保证产品的质量，规避潜在风险；最后还要关注贮存和运输环节的管控，原料和成品均需存放在干燥通风的环境中，并避免与其他可能污染的食品接触。运输中需要妥善包装，使用恰当的工具进行运输，以免受到外界污染。简言之，厂家需对食品生产的全过程进行管控，从源头上降低食源性疾病的发生率，保障宠物食品安全。夏季更要注意少量多次购买，尽量购买小包装，保证新鲜度；其次要做好储存，密封包装于阴凉干燥处储存，已开封的产品尽量保留原始包装（银色铝箔衬袋），并尽快使用，尽最大可能规避因粮桶材质不安全和密封性不好带来的风险。
