Figure 1 发表于Archives of Virology的文章Molecularepidemiology of type I and II feline coronavirus from cats with suspectedfeline infectious peritonitis in China between 2019 and 2021
该研究收集了2019-2021年国内21个省市120例疑似猫传腹病例,对该120例腹水样本进行猫冠状病毒和其他病毒的检测。同时,还对检出FCoV阳性中的94例样本进行Sanger测序以鉴定S基因M1058L位点的突变,并构建进化树进行系统发育分析。
该项研究通过流行病学及病毒抗原检测结果结合统计学数据分析得出FCoV患病率与患猫年龄显著相关(P<0.01),而与性别、品种、地域或混合感染猫白血病病毒(FeLV)和猫免疫缺陷病毒(FIV)无显著相关性(P>0.01)。
Figure 2 FCoV患病率与患猫年龄、性别、品种、地域、病毒共感染的关系
通过本研究中的序列分析,得出:
1)FCoV-I为中国目前主要流行的血清型:78例FIP患猫腹水样本部分S基因测序结果为77例FCoV-I;
2)六核苷酸的缺失可能是中国区域I型FCoV株的特征之一。该77份检出为FCoV-I的样本中SD/202012/003与另76份相比出现了6个核苷酸的缺失;
Figure 3 部分S基因序列比对,显示I型FCoV的六核苷酸缺失
3)S基因M1058L位点的突变是主要突变位点。对94例FIP患猫的腹水样本的部分S基因进行扩增分析,其中89例(89/94,94.68%)在23531碱基位是T(78/94,82.98%)或C(11/94,11.70%),而5例在该位是A(5/94,5.32%),表明94.68%的菌株在Spike蛋白1058位的蛋氨酸突变为亮氨酸,证实了先前研究所得结果的真实性,并暗示这一突变位点可以作为诊断FIP的一个指标,为现在临床FIP诊断如何区分FCoV的两种生物型提供了思路。
本篇文章中针对疑似FIP患猫腹水样本的核酸检测是使用上海基灵生物科技有限公司的猫传染性腹膜炎病毒核酸检测试剂盒。
基灵猫传腹核酸检测在诊断FIP方面具有多重独特的优势 1)核酸检测是诊断是临床表现疑似传腹的患猫是否真正感染致病病原的最直接证据;相较于一直被视为FIP诊断金标准的免疫组化染色,核酸检测方法可操作性强且结果易于判读(用于核酸检测的样本更好获取,并且可实现活体诊断); 2)本文提及的基灵InCycle®全自动核酸检测系统,该系统将核酸提取、扩增和结果分析集成于同一密闭环境下,真正的实现样本进结果出,又能避免人为干扰带来污染的风险; 3)区分FECV和FIPV一直是确诊FIP的关键和难点。基于本文的研究结果,该病毒S基因1058突变位点应作为FIP的诊断指标,进一步验证了基灵InCycle®全自动核酸检测系统(猫传腹检测试剂盒)能够有效检测该突变位点的FIPV,更精准的诊断猫传染性腹膜炎。 Reference: Lin, L., Yao, D., Wu,L. et al. Molecular epidemiology of type I and II felinecoronavirus from cats with suspected feline infectious peritonitis in Chinabetween 2019 and 2021. Arch Virol (2021). https://doi.org/10.1007/s00705-021-05291-9