北京时间2022年2月16日,国际顶级学术刊物Cell在线发表了南京农业大学动物医学院/前沿交叉研究院联合中山大学医学院等国内外单位完成的研究论文:“Virome characterization of game animals in China reveals a spectrum of emerging pathogens”。论文共同通讯作者为我校粟硕教授(Lead contact)、中山大学施莽教授、悉尼大学爱德华·霍尔姆斯教授。我校博士研究生何婉婷、中山大学博士研究生侯新、我校硕士研究生赵晋为论文共同第一作者。这是南京农业大学首次以第一通讯作者单位在CELL发表研究成果,也是我国动物传染病防控领域的突破性研究进展。
在本研究中报道了豪猪丁型冠状病毒(Deltacoronavirus HKU17),牛副流感病毒3型(Bovine parainfluenza virus 3)、哺乳动物正腮腺炎病毒5型(Mammalian orthorubulavirus 5)、H9N2亚型流感病毒(Influenza A virus H9N2)等21种对人类和家畜具有潜在高传播风险的病毒。发现貉、果子狸、竹鼠、豪猪、刺猬等多种野生动物可携带冠状病毒,其中腹泻的貉样本中携带的四株新型犬冠状病毒(Canine coronavirus,CCoV)与最新报道的可导致人类疾病的重组CCoV毒株CCoV-HuPn-2018的基因同源性达93.65%-94.27%;基于病毒刺突蛋白(Spike protein, S)中的非重组区域分析发现四株新的貉CCoV形成了一个单独的谱系(图2)。因此,这种冠状病毒的跨物种传播风险值得关注。本研究还发现了多种高丰度的轮状病毒(Rotavirus),包括A、B、C、D和I群。兔、貉、豪猪和海狸鼠等动物均携带轮状病毒A群。同时高丰度的轮状A群、C群和I群的共感染在腹泻的貉中发现,提示轮状病毒存在跨物种传播和公共卫生风险。
本研究受到国家自然科学基金优青基金(31922081)等项目支持资助,同时貉冠状病毒流行病学研究得到了国家重点研发计划项目课题“畜禽冠状病毒的流行传播特征与遗传演化规律研究(2021YFD1801101)”支持资助。