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新技术推介 | LAMP快检技术平台创建

2023-10-24 406 返回列表

LAMP快检技术平台创建

中国检验检疫科学研究院

LAMP(Loop-mediated isothermal amplification)技术是一种新型核酸扩增技术,具操作简单、反应快速、灵敏度高、特异性强等优点,在疫病检测、食品安全、环境监测等领域具广泛应用前景。然而,其在临床应用中尚存在一些瓶颈问题,如核酸物质快速抽提技术、多重检测体系的创新与优化、结果的快速判定与精准判定、假阳性结果的规避及现场诊断一体化平台设计等,中国检科院科研团队针对以上问题,研究创建了LAMP快检技术平台,以期切实提高LAMP技术的临床适用性,满足基因现场即时诊断需求。

1、创新LAMP检测理念,实现精准鉴别:鉴于LAMP结果判定不具特异性,研究团队借助核酸内切酶酶切技术进行LAMP产物的复核鉴定,分别建立施马伦贝格病毒(SBV)、派琴虫LAMP检测技术,实现了病原鉴别诊断;创建LAMP-RFLP多重检测技术体系,建立了猪瘟病毒和猪繁殖与呼吸综合征病毒双重LAMP检测技术,利用特异性酶切位点实现了两种病毒的同步鉴别检测;在内引物poly T区引入外源性酶切位点,建立锦鲤疱疹病毒(KHV)/鲤春病毒血症病毒(SVCV)双重LAMP检测方法,实现了两者的鉴定;并进一步创建流行性造血器官坏死病病毒(EHNV)/传染性造血器官坏死病病毒(IHNV)/病毒性出血性败血症(VHSV)三重LAMP-RFLP检测技术体系,实现三种靶标同步检测与鉴定。

2、创制LAMP基础反应液及新型染料,打破国外试剂垄断,优化体系设置,提升检测通量:在国内检验检测领域率先引入LAMP快检理念,创制并优化LAMP检测技术体系,成功研制LAMP基础反应液,60min内可实现真鲷虹彩病毒检测,灵敏度与进口试剂相当,填补了国内空白;创新性精简LAMP引物体系,降低冗余引物间相互干扰,创制三种家禽病毒多重LAMP检测方法,引物由12条减至6条;创制新型LAMP染料Dye63,填补国内LAMP核酸指示剂空白,与日本专利产品Calcein相比,敏感性提高10倍,反应延迟时间缩短50%左右,助力实现LAMP闭管检测,有效规避气溶胶污染;创新性将LAMP与微流控芯片技术相结合,建立的6种重要猪病LAMP-CHIP检测法突破了LAMP检测通量低的瓶颈。

图1. 6种猪病LAMP-CHIP检测法芯片图

A. 芯片实图;B. 芯片结构示意图: 每张芯片可同时检测2个样品(样品1扩增区、样品2扩增区),每个样品进行6种猪病毒靶基因的多重检测(12个反应池:6个检测池、2个阳性对照、2个阴性对照及2个空白对照),全封闭设计有效避免交叉污染,1个样本仅需1次加样,每个反应池仅需1.4微升反应液,是单管式LAMP法的1/20。

3、创新研发LAMP配套技术解决方案,致力突破LAMP在即时诊断中的瓶颈问题:自主研发1种新型组织裂解液,更为安全有效,30min内可完成各类临床样本核酸抽提;创制具自主知识产权的核酸快速提取管,摒弃对离心机、移液器等仪器耗材的依赖,一管式操作,于15min内即可获得高纯度核酸物质;针对痰液、拭子等液态样本,自主研发病原体免抽提直扩缓冲液,作用5min即可进行扩增;研制便携式双通道实时荧光二合一恒温分子检测仪M16,获软件证书,可实现检测结果自动上传,根本上解决了LAMP现场诊断缺乏便携式装备的卡脖子问题。

图2. 基于LAMP创新型体系的样品检测流程图

4、成功搭建数十种动物疫病、物种成分、过敏原等集成化快检平台,技术支撑疫情监测、口岸把关及市场监管工作:创制高致病性禽流感、转Bar基因和虾源性成分等30余种陆生动物疫病、水生动物疫病、人畜共患病及物种、转基因和过敏原成分的LAMP检测技术,获多项自主知识产权,完善了我国疫情防控及市场监管快检技术平台的集成与优化。

研究成果形成行标7项,获得发明专利12项,实用新型专利1项;发表高质量论文23篇;研制国家标准物质9项;3项成果获得转化;培训学员千余人次。成果在口岸及国内动物检疫、动植物产品生产和质检企业中进行了推广应用,保障了超2万批次、货值超20亿元动植物产品和食品的质量安全,为保障市场流通领域生物安全和食品安全发挥了重要作用。

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