形成“科学研究、技术支撑、成果转化”三大体系，达到全面发展的格局，将建成渔业科技创新、高新技术成果转化、学科齐全、贡献较为突出、在省内外具有广泛影响的地市级研究所，成为我市渔业科技创新、服务“三农”、推进渔业现代化建设、发展海洋经济的主要科技支撑力量，成为我省水产行业不可或缺的科研机构。
★形成科学研究体系：重点在渤海湾渔业资源调查与评价、渔业资源承载力研究、生境保护与修复、渔业生态环境监测与评价、增养殖水域生态环境调控与修复、渔业水域建设项目环境影响评价等方面；盐碱水综合开发利用、盐碱水养殖环境改良技术、土著鱼虾类耐碱机理及良种选育、提纯与复壮等方面建设一批具有先进水平的优势特色学科，使我所在应用基础研究和前沿技术研究方面综合实力显著增强，解决渔业重大科技问题、支撑行业发展能力方面得到显著提升。★形成技术支撑体系：就是以解决海洋及渔业资源调查监测、渔业环境监测、水产健康养殖、渔业信息化等渔业行业管理中的重大技术性问题和公益性问题为目标，培养和稳定人才队伍、搭建工作平台，配置先进仪器设备，提升我所为政府渔业决策、行业管理以及公众服务的能力。★形成成果转化体系：就是加强成果转化的实用技术集成示范、实验基地和培训基地建设，开展技术咨询、技术推广、技术培训等，推进成果转化示范，提升我所科技成果转化能力，推动我市及全省渔业产业升级，促进产业结构调整和渔民增收。海洋生物制品加工与综合利用、海洋生物活性物质提取合成药物、海洋生物制品的研发及商品化。 针对水产科学研究中的重大科学技术问题，利用细胞工程、酶工程、蛋白质工程等现代生物技术方法，开展新品种培育、水环境改良、生态调控、酶制剂与蛋白质产品开发、益生微生物规模化发酵技术，充分发挥现代生物技术对水产科学发展的推动作用。
