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中国智造 不止可靠丨中科基因携手华大智造推出 PRRSV 全基因组测序方案

2025-02-25 114 返回列表

来源:山东省兽医协会

2023年8月24日,华大智造与北京中科基因股份有限公司(以下简称“中科基因”)宣布达成战略合作。双方将基于华大智造测序平台和自动化建库平台在兽医检验检测及疫病防控等方面互利共赢,构建可持续发展的战略合作关系。

“在兽医实验室检测方面,中科基因一直致力于打造引领行业发展的诊断检测技术平台和标准化的动物疫病检测体系。自2023年8月与华大智造战略合作以来,中科基因基于华大智造领先的基因测序平台,不断开发出适用于兽医检验检测的高通量测序产品和服务,其中包括宏基因组测序产品及服务、猪核心病原靶向检测产品及服务、全基因组测序产品及服务等。”

图1:中科基因病原检测流程图

猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcinereproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)引起的猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)是对世界养猪业影响最大的疾病之一。PPRSV可感染各年龄段猪群,能够引起母猪繁殖障碍(母猪流产,产木乃伊胎、死胎以及早产等)以及仔猪和育成猪呼吸道症状,导致高死亡率,给全球养猪业造成了巨大损失。

图2:PRRSV基因组图谱

(图片来源于https://mp.weixin.qq.com/s/hF_NlQxmi6b-l_uJt3X5Qw)

PRRSV全基因组测序整体解决方案

中科基因联合华大智造,使用中科基因超灵敏PRRSV全基因组捕获试剂盒和微生物全基因组分析系统,结合DNBSEQ测序平台和CycloneSEQ测序平台,形成“试剂+仪器+分析”的实验室整体解决方案。中科基因正式对外推出猪繁殖与呼吸综合征病毒全基因组测序服务,提供多样本类型的PRRSV全基因组捕获试剂盒测序服务和自动化整体解决方案。

图3:PRRSV全基因组测序整体解决方案

01

产品介绍

依托于全基因组测序技术平台,中科基因全面开展PRRSV全基因组测序外送服务,满足变异和重组检测、分型溯源、进化树分析等多种分析需求,可提供核酸提取、文库制备、上机测序和数据分析的全流程服务。

02

产品性能

在华大智造DNBSEQ二代测序平台和CycloneSEQ三代纳米孔测序平台,NADC30、NADC34、JXA1和VR2332毒株均可获得高质量的测序数据和大于95%的PRRSV全基因组覆盖度。

03

中科基因一站式微生物全基因组分析系统

目前该分析系统包括:PRRSV GP5一代测序序列分析、PRRSV二代测序基因组序列分析、PRRSV三代测序基因组序列分析模块,可自动化生成检测报告。

图4:中科基因微生物全基因组分析系统分析界面展示

04

自动化生成产品报告

依托于中科基因一站式微生物全基因组分析系统,可快速生成PRRSV全基因组测序分析报告,满足结构变异、重组检测、分型溯源、进化树分析等多种分析需求。

图5-1:系统发育树

图5-2:基因组结构差异

图5-3:详细重组分析结果

05

PRRSV全基因组测序自动化解决方案

为应对复杂样本及多应用场景,中科基因针对不同类型的样本和复杂的应用场景提供全面的PRRSV基因组自动化整体解决方案。

04

CycloneSEQ测序平台整体解决方案

中科基因自动化核酸提取仪+VetAIseq PRRSV全基因组捕获panel+CycloneSEQ纳米孔测序平台快速高效获得PRRSV的全基因组序列。

图6:基于CycloneSEQ测序平台的PRRSV全基因组测序整体解决方案

04

DNBSEQ测序平台整体自动化解决方案

中科基因自动化核酸提取仪+VetAIseq PRRSV全基因组捕获panel+MGISP-100/MGISP-960自动化建库仪+DNBSEQ二代测序平台快速高效获得PRRSV的全基因组序列。

图7:基于DNBSEQ测序平台的PRRSV全基因组测序整体解决方案

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